Where the Bees Make Honey cuenta una historia acerca de reflexionar sobre diferentes momentos desde una niñez, los cuales son jugados y experimentados desde una perspectiva adulta. Desde su base, Where the Bees Make Honey es un juego puzzle de aventura, pero jugabilidad variada se filtra a lo largo. Es una soñadora, etérea y cuidadosamente elaborada experiencia acerca de la nostalgia. El juego captura ese período de gracia en una infancia en donde jugar a los disfraces era más grande que la vida y cambiaba los entornos que te rodeaban. Cuando la protagonista principal del juego, Sunny, es una adulta reflexionando sobre los tiempos en los que era joven, el juego es experimentado en una perspectiva en primera persona. Éste período de transición toma lugar en su espacio de trabajo, donde ella se encuentra finalmente en una encrucijada con qué hacer a continuación con su vida. Las viñetas interactivas permiten al juego transicionar a cada estación. Esto permite un enfoque más centrado para la narración y la participación del jugador. Las viñetas ofrecen una perspectiva adicional de la estación que preceden. La jugabilidad varía considerablemente entre estaciones, viñetas y momentos.